水产种业是水产行业发展的重要基础和核心命脉，水产种业科技创新牢固支撑了我国水产养殖业的大国地位。为推进渔业高质量发展，有效加强种业创新攻关，发掘优异基因资源，研发先进育种技术，创制优异种质，培育突破性新品种，水科院于2021年启动种业创新攻关计划，设立强种工程、培优工程和赶超工程，珠江所有6个物种列入计划，其中罗非鱼被列为强种工程。围绕罗非鱼抗链球菌新品种培育与新种质创制开展了系列研究工作，取得了重要进展。
一是全面收集了吉富罗非鱼、奥利亚罗非鱼、橙色莫桑比克罗非鱼等多种罗非鱼的种质资源，补充了罗非鱼水产种质资源库。
二是建立了不同罗非鱼物种间杂交与鉴定的方法；组装了橙色莫桑比克罗非鱼的基因组；构建了吉富罗非鱼和橙色莫桑比克罗非鱼性别标记辅助的性控育种方法体系。
三是基于罗非鱼核心种群和抗链球菌病家系选育，开展了罗非鱼抗链球菌病经济性状遗传解析。针对链球菌易感和非易感群体，解析了抗病相关的SNP、INDEL序列、抗病相关的候选基因和信号通路；针对链球菌病抗病和敏感个体的F2代全同胞家系的亲本和子代，通过简化基因组测序，获得了罗非鱼抗链球菌病的关联区3个和关键候选基因240，解析了系列抗病相关基因的功能；解析了罗非鱼感染无乳链球菌后免疫细胞数量变化以及无乳链球菌免疫逃逸机制；构建并获得了抗无乳链球菌病吉富罗非鱼家系42个；完成验证了尼罗罗非鱼抗链球菌病的SNP标记27个，单倍型标记9个。
